GMT4 → GMT5

GMT5相对于GMT4有很多功能上的更新以及语法上的改进。最大的变化在于,GMT5中所有GMT命令必须以 gmt 开头。

GMT4中使用 psbasemap 命令绘制底图、使用 pscoast 绘制海岸线。 psbasemappscoast 都是GMT4提供的命令,每个命令均对应一个可执行文件。GMT4总共提供了上百个命令,这带来一个命名空间污染(namespace pollution)的问题。即不同的软件提供了相同名字的命令,导致不同命令之间出现冲突,使得用户难以确认自己执行的 pscoast 命令是由GMT提供的还是其它软件包提供的。

为了解决这个问题,GMT5对源码做了大量改写。GMT5中只提供 gmt 这一个命令/可执行文件。GMT4中的所有命令在GMT5中都变成了 gmt 命令的模块。所有模块都以 gmt module options 的形式进行调用。例如,GMT4中的命令 psbasemap 在GMT5中应写为 gmt psbasemap

因而,将GMT4脚本迁移到GMT5下,只需要遵循如下步骤:

  1. 将所有GMT4命令前加上 gmt,即 psbasemap 改成 gmt psbasemap

  2. 保存并执行脚本。若出现报错,则找到最早的报错信息并查询当前GMT版本对应的文档,检查是否语法存在变化,并进一步更正。

GMT提供了脚本 gmt5syntax,可以自动在GMT4命令前加上 gmt,该脚本位于 GMT的 share/tools 目录下。该脚本的使用方法也很简单:

gmt5syntax old_script.sh > new_script.sh

如果不愿意修改原脚本,GMT还为旧命令提供了软链接,使得依然可以直接使用 psbasemap 等命令,但极其不推荐这一方法。为旧命令生成软链接有多种方法,用户可任选其一即可:

  1. 如果你是自行编译GMT源码并安装,则可以在 cmake/ConfigUser.cmake 中加上 set (GMT_INSTALL_MODULE_LINKS TRUE) 再进行编译安装

  2. GMT提供了一个脚本,可以用于检查软连接是否存在,同时也可以创建或删除软连接。对于已经安装GMT的用户,可以执行以下命令以检查软连接是否已经存在:

    $(gmt --show-sharedir)/tools/gmt_links.sh
    

    执行如下命令为所有旧GMT命令创建软连接(可能需要root权限):

    $(gmt --show-sharedir)/tools/gmt_links.sh create
    

    也可以执行如下命令删除已有的软连接:

    $(gmt --show-sharedir)/tools/gmt_links.sh delete
    
  3. 对于Bash用户,可以直接在Bash脚本、终端或者Bash配置文件中加入如下语句:

    source $(gmt --show-sharedir)/tools/gmt_functions.sh
    

    该脚本会为所有旧命令构建一个等效的bash函数。

  4. 对于csh用户,可以直接在csh脚本、终端或者csh配置文件中加入如下语句:

    source `gmt --show-sharedir`/tools/gmt_aliases.csh
    

    该脚本会为所有旧命令构建一个等效的csh别名。